种生物可以排成一个有规则的系统，结束了过去生物学在分类命名上的混乱现象。
在1735年出版的《自然系统》一书中，林奈把自然界存在的植物、动物、矿物三大类，分为纲、目、属、种，实现了分类范畴的统一。他以种为分类的最小单位，根据花的数量、形状和位置，再分成属。根据各属子实体的主要特征划分为纲，并把容易概括的属列为纲以下的目。这就形成林奈闻名于世的性系，其中纲主要取决于雄蕊数，目根据雌蕊数。对动物界的分类，林奈没有提出任何共同适用的原则。但是，他把鲸归入四足类共采用哺乳类的名称。他还把人和四足动物同样列人哺乳动物纲，并把人和猿猴一起列人了灵长目。
林奈对生物学的贡献是划时代的，对于我们人类认识自身在自然万物中的位置具有决定性的意义。可以毫不夸张地说，是林奈给人做出了科学的定位。自此，世界上的每一个民族或人类个体都可以通过界、纲、目、属、种、亚种逐级找到自己在自然界的位置。从生物属性上说，人不再是独立于自然万物之外的幽灵，也不是什么天神的特殊造物，她仅仅是生命长链上的一个活环，是生物之树上的枝条，如果没有其他物种的支撑，人类这个枝条也将枯萎，无法在天地间独存。恩格斯评价说，植物学和动物学由于林耐而达到了一种近似的完成。
林奈是一位博学大家，他除了在医学、生物学、地理学等方面作出了很大贡献以外，也为其它学科做出了很大贡献。1739年，他和其他学者一起创建了瑞典皇家科学院，旨在代表瑞典经济界的利益促进科学研究。他还编写了一部有关瑞典民俗、重点介绍瑞典民间舞蹈的书籍，为民俗学研究也做出了贡献。1778年1月10日，经历一系列中风之后，林奈在瑞典乌普萨拉去世。</p>
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