刘秀称帝后，刘玄便把主要精力用来对付刘秀。要打刘秀，自然是先对付最逼近长安的邓禹。此时邓禹正在围困安邑县（今运城市），已经把安邑县围了几个月，但他围而不打。为什么呢？因为他不想进展得太快。邓禹太懂刘秀了，刘秀派他往长安进发，但却不希望是他杀刘玄，让刘秀背上弑君的罪名。邓禹一直等赤眉进长安，灭了刘玄，然后自己再收“渔翁之利”。想不到的是，刘玄竟然不顾兵临城下的赤眉军，而是派了樊参率领几万人从太阳渡过黄河攻击邓禹。邓禹对刘玄这个决定只能摇头苦笑，樊参这个“奴才”又如何是自己的对手？邓禹只是略施小计，便在解县击败了樊参军，杀了樊参。
刘玄见樊参失败，迅速派了王匡、成丹、刘均率领十多万人继续攻击邓禹。邓禹手上只有兵力几万，而且刚和樊参打完，兵乏马困，面对几倍的更始军的攻击，邓禹遭到失败，连连后退。如果王匡一鼓作气对邓禹发动猛攻，邓禹必败无疑。可笑的是，第二天王匡竟然停止了对邓禹的进攻，理由是当天是忌日（癸亥，公元25年6月26日，六甲穷日，即是千支记日的最后一天），不愿出战。邓禹便利用了这一天的时间，重新调整部署了自己的军队。王匡的战机就此失去。27日，王匡对邓禹发动攻击，但此时的邓禹正在等着他们的到来。邓禹在营垒埋伏重兵，等王匡的军队过去一半，突然从中杀出，王匡军顿失大乱，被邓禹打的大败。王匡率败军往河东逃跑，邓禹紧追不舍，杀了刘均和河东太守杨宝，顺势平定了河东。王匡只好逃回长安。
王匡的失败彻底击垮绿林人意志与信念，赤眉军与邓禹的夹击让绿林人觉得必败无疑（这个感觉还是对的），不如抢了长安的财物回南阳继续做强盗算了。这个意见的带领人是张卯，他就是在立刘玄为帝的关键人物，要不是他在会议上霸气的大剑一挥，刘玄说不定坐不上皇位。当初
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