刘玄死后，刘秀再无后顾之忧，赤眉暴虐，不得人心，刘秀希望邓禹西进踏平赤眉，夺取关中。但邓禹即使拥军百万，却迟迟不肯对关中发动攻击，而是继续在关外攻城略地，断关中臂膀。刘秀对邓禹的决策甚为不满，认为赤眉在关中不得人心，只有对长安发动攻击，夺取关中不在话下；但是，邓禹对刘秀的催促当作耳边风，找理由推托，正所谓：将在外，军命有所不从。
对于邓禹拒绝执行刘秀的命令，史学界有争论，有人认为刘秀的主张是对的，以邓禹的军事才能应该可以迅速平定关中；而支持邓禹的人认为，赤眉军刚得长安，屁股没坐热，若此时有人过来争抢，必死命反抗，邓禹即使夺得关中也要付出沉重的代价。本人当然支持第二种意见，不可否认，邓禹有能力夺取关中，但代价必定是杀敌一千，自损八百。樊崇有三十万人，经历过战争的洗礼，骁勇善战，而邓禹的军队都是饥民临时加入凑数的，这一点邓禹非常清楚，樊崇当初把王莽的军队打得落花流水，邓禹不得不谨慎一点。另外，最重要的一点，邓禹认为，赤眉在长安不得人心，而樊崇虽有军事才能，却没有治理之道，放纵部下对长安百姓烧杀抢掠，这是樊崇在自废武功，假以时日必自亡，何必我邓禹出手？
邓禹的推测很快得到印证，事件有二：
一，腊日，赤眉设乐大会，酒未行，群臣便争斗。更意外的是，在外的士兵竟然越进宫，杀守卫，为的只是
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